Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm436B1AVU6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm436B1AVU6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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