Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms