Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp36B1AQJ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp36B1AQJ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp36B1AQJ2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp36B1AQJ2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp36B1AQJ2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp36B1AQJ2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp36B1AQJ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms