Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhox1B1APN4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox1B1APN4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox1B1APN4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhox1B1APN4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox1B1APN4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox1B1APN4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox1B1APN4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox1B1APN4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox1B1APN4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhox1B1APN4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms