Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem238A9JSM3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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