Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms