Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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