Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga8A2ARA8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms