Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll9A2APC3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms