Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms