Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SetxA2AKX3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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