Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd1A2AKB4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms