Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm12A2AJ77 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms