Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel3A2AHA7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms