Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap5A2AGT5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap5A2AGT5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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