Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms