Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdl2A2AGA4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms