Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms