Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms