Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp8nlA2ABX0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp8nlA2ABX0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp8nlA2ABX0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp8nlA2ABX0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms