Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Myom3A2ABU4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Myom3A2ABU4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms