Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms