Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms