Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms