Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms