Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms