Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W9

Ighv1-58, Immunoglobulin heavy variable 1-58 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-58A0A075B5W9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-58A0A075B5W9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-58A0A075B5W9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-58A0A075B5W9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-58A0A075B5W9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms