Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv31A0A075B5J5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms