Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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