Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRDP23468 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRDP23468 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRDP23468 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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