Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms