Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms