Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms