Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms