Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccne2Q9Z238 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms