Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms