Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn13Q9Z0S4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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