Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms