Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms