Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms