Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TapbpQ9R233 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TapbpQ9R233 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TapbpQ9R233 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TapbpQ9R233 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TapbpQ9R233 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TapbpQ9R233 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TapbpQ9R233 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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