Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubd1Q9R1K7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms