Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0P4

Smap, Small acidic protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmapQ9R0P4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SmapQ9R0P4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SmapQ9R0P4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms