Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NrkQ9R0G8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NrkQ9R0G8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrkQ9R0G8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NrkQ9R0G8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms