Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms