Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms