Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc3Q9R0B6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc3Q9R0B6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc3Q9R0B6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc3Q9R0B6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc3Q9R0B6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc3Q9R0B6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc3Q9R0B6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Lamc3Q9R0B6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lamc3Q9R0B6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms