Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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