Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d3cQ9QZS8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms