Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col4a3Q9QZS0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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